Ο Γιάννης Βαρδουλάκης γεννήθηκε στις 22/3/1949 στα Χανιά και αποφοίτησε από τη Σχολή το 1966. Έλαβε το δίπλωμα Πολιτικού Μηχανικού από το ΕΜΠ το 1972 και το Διδακτορικό Δίπλωμα Μηχανικού στην Εδαφομηχανική από το Πανεπιστήμιο της Καρλσρούης της Γερμανίας το 1977. Διετέλεσε ερευνητής στην Καρλσρούη και Καθηγητής της Γεωμηχανικής στο Πανεπιστήμιο της Μινεζότας των ΗΠΑ, μέχρι την εκλογή του σε θέση Καθηγητή στο ΕΜΠ το 1990.
Για την προσφορά του τιμήθηκε με το βραβείο Bishop για τη γεωτεχνική έρευνα από το Ίδρυμα Πολιτικών Μηχανικών του Ηνωμένου Βασιλείου και το μετάλλιο «Εξαίρετης Έρευνας στην Γεωμηχανική» από τον Ιαπωνικό Γεωτεχνικό Σύλλογο.
Για την έρευνά του διεκδίκησε και έλαβε χρηματοδότηση, με σημαντικές ερευνητικές προτάσεις, η κορωνίς των οποίων ήταν το τελευταίο μεγάλο ευρωπαϊκό του πρόγραμμα στο πλαίσιο του ΙDEAS. Με τις προσπάθειες του έστησε ένα σπουδαίο ερευνητικό εργαστήριο στο ΕΜΠ άρτια εξοπλισμένο.
Απεβίωσε μετά από κρανιοεγκεφαλικό κάταγμα από πτώση στις 6 Σεπτεμβρίου του 2009 σε ηλικία 60 ετών.